Dijelaskan: Apa sub-garis keturunan AY.12 baru dari varian Delta, dan haruskah Anda khawatir?

Varian Delta (B.1.617.2) telah melahirkan beberapa sub-garis keturunan yang disebut varian 'Delta Plus' yang memiliki sebagian besar mutasi karakteristiknya tetapi berbeda dalam hal lain. Salah satu dari sub-garis keturunan ini, AY.12, memiliki semua karakteristik mutasi Delta kecuali satu.

Orang-orang mengantre untuk menerima dosis vaksin Covid-19 di pusat vaksinasi sementara yang didirikan di dalam sebuah sekolah di Mumbai, Selasa, 17 Agustus 2021. (Foto PTI/Kunal Patil)

Ketika dunia dengan gugup melacak semua varian Covid-19 baru dan sub-garis keturunannya, setiap sampel virus secara teknis adalah 'varian' baru, karena urutannya tidak cocok dengan urutan virus lainnya.

Sekarang, para ilmuwan telah memperluas keluarga Delta dari empat menjadi 13 varian. Beberapa kasus dari varian delta , varian kekhawatiran yang paling umum di India, sedang direklasifikasi ke sub-garis keturunan lain — AY.12 — yang telah dikaitkan dengan sejumlah besar kasus di Israel, konsorsium India SARS-CoV-2 Genome (INSACOG), yang melacak varian yang muncul, kata dalam sebuah laporan.

Namun, karena definisi AY.12 tidak konsisten, angka akhir akan memakan waktu, demikian bunyi pernyataan konsorsium.

Nah, apa sih mutasi AY.12 ini?

Pada dasarnya, evolusi virus bekerja seperti jenis lainnya. Saat virus menyebar ke seluruh tubuh, virus membuat salinan dirinya sendiri, yang sering kali memiliki kesalahan dan perubahan kecil.

Dengan demikian, varian Delta (B.1.617.2) telah melahirkan beberapa sub-garis keturunan yang disebut varian 'Delta Plus' yang memiliki sebagian besar mutasi karakteristiknya tetapi berbeda dalam hal lain. Salah satu dari sub-garis keturunan ini, AY.12, memiliki semua karakteristik mutasi Delta kecuali satu.

Lonjakan kasus di Israel menjadi perhatian karena ini adalah negara dengan hampir 60% orang dewasanya divaksinasi lengkap dan melaporkan bahwa efektivitas vaksin Pfizer di negara itu secara signifikan lebih rendah daripada yang muncul selama uji klinis. Reklasifikasi ini terutama untuk membantu mikro-epidemiologi dan tidak didasarkan pada akuisisi mutasi yang signifikan. Dengan demikian, saat ini tidak diketahui apakah AY.12 berbeda secara klinis dari Delta, catat laporan INSACOG. Tidak ada mutasi baru yang menjadi perhatian yang dicatat dalam protein lonjakan (S). Namun, pertumbuhannya yang cepat di Israel berarti harus diperiksa lebih lanjut.

Apakah ada perbedaan antara AY.12 dan strain lainnya?

Menurut INSACOG, belum diketahui apakah AY.12 berbeda secara klinis dengan Delta atau B.1.617.2.

Namun, AY.12 telah kehilangan beberapa mutasi yang terlihat pada garis keturunan Delta, seperti G142D pada protein lonjakan. Tidak ada mutasi baru yang menjadi perhatian yang dicatat dalam protein lonjakan varian ini.

AY.12 adalah, saat ini, strain yang paling dominan di Israel - 51 persen dari sampel yang diteliti telah menunjukkan prevalensi varian ini. Berdasarkan jumlah sekuens yang sejauh ini telah diunggah di GISAID oleh kelompok penelitian India, prevalensi varian ini selama seminggu terakhir telah meningkat hingga lebih dari 20 persen.

Sambil meminta negara bagian untuk menjaga kehati-hatian dan mencari varian ini, INSACOG mengatakan: AY.12, sub-garis keturunan Delta yang dipindahkan terlihat di banyak negara bagian, tetapi jumlahnya perlu diperiksa lebih dekat. Dampak fungsional dari perubahan antara Delta dan AY.12 tidak diketahui tetapi keduanya tampak sangat mirip pada tingkat molekuler.

Sejauh ini, menurut INSACOG, sekitar 70.000 sampel virus corona telah diurutkan untuk struktur genomnya, di mana 50.000 di antaranya telah dialokasikan ke berbagai garis keturunan. Sekitar 60% dari mereka terdiri dari varian internasional yang menjadi perhatian atau minat (VoC atau VoI) yang secara global dilacak dan dikaitkan dengan wabah serta contoh terobosan vaksin dan infeksi ulang. Dalam VoC ini, varian Delta terdiri dari 70% sampel. Kasus Delta plus, di mana AY.12 disertakan, hanya nomor 67, meskipun ini diperkirakan akan membengkak setelah reklasifikasi.

Melacak evolusi

Outbreak.org, yang melacak varian baru dan prevalensinya, menyatakan bahwa kasus pertama dari garis keturunan AY.12 tercatat pada 7 September 2020. Sejak itu, 44.083 urutan dalam garis keturunan AY.12 telah terdeteksi di seluruh dunia hingga Agustus. 26.

Namun, varian muncul ke permukaan setelah menjadi strain dominan di Israel. Gelombang infeksi keempat dengan cepat mendekati tingkat hari-hari terburuk pandemi di Israel musim dingin lalu. Tingkat harian kasus virus baru yang dikonfirmasi telah meningkat lebih dari dua kali lipat dalam dua minggu terakhir, menjadikan Israel sebagai hot spot yang meningkat di tangga lagu internasional. Pembatasan pertemuan dan tempat komersial dan hiburan diaktifkan kembali minggu ini, dan pemerintah sedang mempertimbangkan penguncian baru.

Namun, masalah yang paling dikhawatirkan oleh para ahli adalah bahwa tingkat infeksi Israel yang tinggi di antara penerima vaksin awal dapat mengindikasikan berkurangnya perlindungan vaksin dari waktu ke waktu, sebuah temuan yang berkontribusi pada keputusan AS untuk mulai menawarkan suntikan penguat kepada orang Amerika secara luas mulai tahun depan. bulan. Vaksin mungkin kurang efektif dalam mencegah infeksi dengan varian Delta A.12 yang sangat menular, yang sekarang menjadi versi utama virus di Israel.

Data yang diterbitkan oleh Kementerian Kesehatan Israel pada akhir Juli menunjukkan bahwa suntikan Pfizer hanya 39% efektif untuk mencegah infeksi di negara itu pada akhir Juni dan awal Juli, dibandingkan dengan 95% dari Januari hingga awal April. Namun, dalam kedua periode, suntikan itu lebih dari 90% efektif dalam mencegah penyakit parah. Dengan demikian, Israel sekarang menggantungkan harapannya pada tembakan penguat.

Menurut Outbreak.org, sampel pertama AY.12 di India berasal dari 7 September 2020.

INSACOG sejauh ini telah mengurutkan 67.699 sampel virus dari India, di mana 50.869 telah dianalisis secara rinci. Tambahan 11.016 urutan sampel telah dibagikan oleh pemerintah negara bagian — menjadikan jumlah total sampel yang diurutkan menjadi 78.865.

Namun, tren yang mengkhawatirkan adalah karena lebih dari 3,2 crore orang telah terinfeksi di India sejauh ini, hanya sekitar 0,002% dari sampel yang telah diurutkan hingga saat ini.

Apa yang penting bagi orang awam?

Tidak semua varian yang diakui Organisasi Kesehatan Dunia sama buruknya. Ketika organisasi memberi nama keluarga baru, itu juga menambahkan label yang memberi tahu kita betapa khawatirnya kita.

Level terendah adalah varian minat, yang berarti layak untuk diperhatikan. Di tengah adalah varian perhatian, seperti Delta, yang telah berevolusi menjadi lebih berbahaya. Seringkali, varian minat diberi label itu karena mereka berbagi mutasi dengan varian perhatian—mereka berada di bawah pengawasan. CDC memiliki kategori tambahan yang lebih parah, varian konsekuensi tinggi, yang belum pernah diberikan kepada keluarga Covid. Ini dicadangkan untuk strain potensial di masa depan yang dapat menyebabkan penyakit serius pada orang yang divaksinasi, gagal muncul pada tes diagnostik yang umum digunakan, atau mungkin menolak beberapa perawatan untuk gejala covid.

Mutasi terjadi secara acak di seluruh genom virus dalam jutaan orang yang terinfeksi. Beberapa dari mutasi itu mati, dan beberapa menyebar ke orang lain. Karena itu, para ilmuwan terus mengamati pola di Delta, terutama karena penyebarannya begitu cepat.

Buletin| Klik untuk mendapatkan penjelasan terbaik hari ini di kotak masuk Anda

Bagikan Dengan Temanmu: