Dijelaskan: Mengapa varian Delta Covid-19 menyebar lebih cepat daripada strain lainnya

Lebih banyak orang yang terinfeksi dengan varian Delta Covid-19 cenderung menularkan infeksi kepada orang lain bahkan sebelum mereka curiga bahwa mereka mungkin sakit.

Seorang penjual yang mengenakan masker sebagai tindakan pencegahan terhadap virus corona memajang mainan untuk dijual di pantai Fort Kochi di Kochi, Kerala, Senin, 23 Agustus 2021. (AP Photo: RS Iyer)

Ketika para ilmuwan menemukan diri mereka berpacu dengan waktu untuk menemukan dasar biologis untuk transmisi varian delta Covid-19, beberapa studi baru telah menemukan bahwa mutasi kunci berkurangnya efektivitas vaksin , dan infeksi yang tinggi selama fase pra-gejala pada pasien adalah salah satu alasan utama yang memicu penyebaran yang cepat.

Penelitian epidemiologi terbaru menunjukkan varian Delta (B.1.617.2) setidaknya 40 persen lebih mudah menular daripada varian Alpha yang pertama kali diidentifikasi di Inggris pada akhir 2020. Selain itu, dengan banyak studi menunjukkan pengurangan efisiensi vaksin terhadap varian Delta, individu yang divaksinasi lengkap juga tetap rentan terhadap infeksi terobosan .

Kepala WHO Tedros Adhanom Ghebreyesus, pada konferensi pers, sebelumnya mengatakan bahwa Delta adalah varian paling menular yang diidentifikasi sejauh ini, dan dengan cepat menjadi strain Covid-19 yang dominan di banyak negara. Menurut presentasi internal yang diedarkan di Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit AS (CDC), varian Delta adalah lebih menular daripada virus yang menyebabkan MERS, SARS, Ebola, flu biasa, flu musiman, dan cacar, dan setidaknya sama menularnya dengan cacar air.

Sumber: JHU CSSE dan covariants.org

Mengapa varian Delta lebih menular?

Penelitian terbaru menunjukkan bahwa mutasi asam amino kunci mungkin berada di balik infektivitas ganas varian Delta.

Sebuah tim peneliti yang dipimpin oleh ahli virologi Cabang Medis Universitas Texas Pei-Yong Shi telah memusatkan perhatian pada mutasi kunci yang mengubah satu asam amino dalam protein lonjakan SARS-CoV-2. Perubahan ini disebut P681R dan mengubah residu prolin menjadi arginin, menurut laporan studi yang diterbitkan dalam jurnal Nature. Perubahan terjadi di situs pembelahan furin protein spike.

Untuk menembus sel, protein lonjakan SARS-CoV-2 harus dipotong dua kali oleh protein inang. Tempat pembelahan furin pada Covid-19 penting karena berarti enzim inang, termasuk furin, dapat melakukan pemotongan pertama. Setelah ini, partikel virus yang baru terbentuk muncul dari sel yang terinfeksi yang dapat menginfeksi sel inang dengan lebih efisien.

Varian Alpha juga membawa mutasi di lokasi yang sama, meskipun terdiri dari perubahan asam amino yang berbeda. Studi tersebut menyatakan bahwa dalam kasus Delta, mutasi yang mengubah pembelahan furin memiliki efek yang mendalam.

Dalam pra-cetak penelitian yang tersedia baru-baru ini, para peneliti menyatakan bahwa protein lonjakan dipotong jauh lebih efisien dalam partikel varian Delta daripada di Alpha, dengan mutasi P681R yang sebagian besar bertanggung jawab atas lonjakan yang dipotong secara efisien.

Studi tersebut menyatakan bahwa mutasi P681R memegang kunci untuk infektivitas tinggi dan transmisi cepat varian Delta. Para peneliti menemukan bahwa dalam sel epitel saluran napas manusia yang terinfeksi, varian Delta menyebar lebih cepat daripada Alpha. Tetapi ketika para peneliti menghilangkan mutasi P681R, perbedaan dalam tingkat penularan hilang.

Studi ini menggemakan temuan penelitian yang dilakukan oleh tim yang dipimpin oleh Kei Sato, seorang ahli virologi di Universitas Tokyo, yang menemukan bahwa protein lonjakan yang mengandung P681R dapat menyatu dengan membran plasma sel yang tidak terinfeksi hampir tiga kali lebih cepat daripada jika mutasi. hilang.

Sumber: CoVariants.org dan GISAID melalui Our World in Data

Apakah mutasi kunci lainnya juga bertanggung jawab atas transmisi cepat Delta?

Para ilmuwan mengatakan bahwa varian Delta memiliki beberapa mutasi kunci dan perubahan P681R, meskipun signifikan, tidak mungkin menjadi satu-satunya alasan yang memicu transmisi cepatnya.

Para peneliti di Uganda mengatakan perubahan P681R hadir dalam varian yang menyebar luas di negara itu pada awal 2021, tetapi belum terbukti menular seperti Delta. Itu varian kappa , saudara Delta yang diidentifikasi di India, juga memiliki mutasi yang sama tetapi para peneliti telah menemukan bahwa protein lonjakannya lebih jarang dibelah dan menyatu dengan membran sel dengan kurang efisien.

Studi sebelumnya telah menemukan bahwa mutasi kunci lainnya dalam varian Delta seperti L452R dan D6146 memungkinkan virus untuk menempel lebih kuat ke sel reseptor dan melepaskan kekebalan dengan lebih mudah.

Faktanya, varian Delta memiliki banyak mutasi pada subunit S1 dari protein lonjakan, termasuk tiga di domain pengikatan reseptor, yang meningkatkan kemampuannya untuk mengikat reseptor ACE2 dan menghindari sistem kekebalan tubuh.

Saya pikir virus berhasil pada volume dan kecepatan. Ini menjadi virus yang jauh lebih efisien. Ini melewati orang dan melalui sel jauh lebih cepat, Gary Whittaker, seorang ahli virus di Cornell University, mengatakan kepada Nature.

Whittaker lebih lanjut mengatakan penelitian tersebut telah menggarisbawahi pentingnya mutasi di situs pembelahan furin dari virus corona. Dia juga menambahkan bahwa P681R tidak akan menjadi mutasi situs pembelahan furin terakhir yang menimbulkan kekhawatiran.

Sumber: CoVariants.org dan GISAID melalui Our World in Data

Mengapa begitu sulit untuk menghentikan penyebaran varian Delta?

Salah satu alasan lain untuk penyebaran cepat varian Delta, seperti yang ditemukan selama penelitian di Guangzhou, Cina, adalah tingkat penularan yang sangat tinggi pada pasien bahkan dalam fase pra-gejala. Ini berarti orang berada dalam bahaya menyebarkan virus bahkan sebelum mereka curiga bahwa mereka mungkin terinfeksi.

Sebuah studi baru-baru ini oleh Benjamin Cowling, seorang ahli epidemiologi di Universitas Hong Kong dan rekan-rekannya, menemukan bahwa orang mulai mengalami gejala 5,8 hari setelah terinfeksi Delta - 1,8 hari setelah mereka pertama kali dites positif untuk RNA virus. Oleh karena itu, ini meninggalkan jendela berbahaya bagi terjadinya penularan virus.

Dengan kata lain, karena timbulnya gejala terjadi kemudian, lebih banyak orang yang terinfeksi varian Delta cenderung menularkan infeksi kepada orang lain bahkan sebelum mereka curiga bahwa mereka mungkin sakit.

Studi ini menemukan bahwa 74% infeksi Delta terjadi selama fase pra-gejala. Para peneliti juga menemukan bahwa R-naught, atau angka reproduksi dasar, yang mewakili, rata-rata, jumlah orang yang diperkirakan dapat menularkan penyakit itu oleh satu orang yang terinfeksi, untuk Delta adalah 6,4. Untuk menempatkan segala sesuatunya ke dalam perspektif, R-naught dari strain Wuhan, menurut beberapa penelitian yang dilakukan sebelumnya, adalah antara 2 hingga 4.

Apakah pengurangan efektivitas vaksin terhadap Delta menjadi perhatian?

Beberapa penelitian telah menemukan bahwa efektivitas vaksin berkurang terhadap varian Delta, yang pada gilirannya membuat individu yang divaksinasi penuh rentan terhadap infeksi terobosan.

Sebuah studi sebelumnya oleh Public Health England telah menemukan bahwa efektivitas vaksin Oxford-AstraZeneca turun ke 64% terhadap varian Delta . Sebelumnya, sebuah penelitian yang diterbitkan dalam jurnal The Lancet juga menemukan bahwa mereka yang divaksinasi penuh dengan vaksin Pfizer cenderung memiliki lebih dari lima kali tingkat antibodi penetralisir yang lebih rendah terhadap varian Delta dibandingkan dengan strain asli.

Baru-baru ini, data dari Kementerian Kesehatan Israel menunjukkan bahwa dua tembakan Pfizer menawarkan perlindungan 64% melawan Covid, pada saat lebih dari 90 persen kasus yang dilaporkan di negara itu disebabkan oleh varian Delta.

Area lain yang menjadi perhatian adalah efektivitas vaksin yang semakin berkurang seiring waktu. Para peneliti di Universitas Oxford di Inggris dan Kantor Statistik Nasional negara itu dalam sebuah studi baru-baru ini menemukan bahwa efektivitas vaksin Pfizer turun hingga 90 persen sebulan setelah mengambil dosis kedua, menjadi 85 persen setelah dua bulan dan 78 persen setelah tiga. Untuk AstraZeneca, perlindungan setara yang ditawarkan adalah 67, 65 dan 61 persen.

Penelitian ini juga menemukan bahwa bahkan pada orang yang divaksinasi penuh, infeksi yang disebabkan oleh varian Delta menghasilkan viral load puncak yang serupa dengan orang yang tidak divaksinasi. Studi yang dilakukan di AS dan Singapura telah menghasilkan hasil yang serupa.

Ini berarti bahwa titik perhatian terbesar adalah bahwa bahkan orang yang divaksinasi lengkap dapat menyebarkan varian Delta, yang membuatnya sangat sulit untuk memutuskan rantai penularan.

Sebuah laporan yang diterbitkan oleh CDC bulan ini menyatakan bahwa setelah pertemuan besar di kota pantai Provincetown di Massachusetts, 469 kasus Covid-19 dilaporkan di negara bagian itu, di mana hampir tiga perempatnya termasuk orang yang divaksinasi.

Pada analisis ditemukan bahwa sama seperti orang yang tidak divaksinasi, mereka yang telah menerima suntikan juga memiliki tingkat yang tinggi Nilai Ct , menunjukkan viral load yang tinggi. Setelah pengurutan genom 133 sampel, 90% kasus ditemukan disebabkan oleh varian Delta. Menyusul temuan tersebut, CDC pada 27 Juli memperbarui pedomannya sekali lagi, dan merekomendasikan dan bahkan orang yang divaksinasi harus memakai masker ketika berada di daerah yang memiliki penularan Covid-19 yang substansial dan tinggi.

Bagikan Dengan Temanmu: