Dijelaskan: Apa yang dimaksud dengan ‘nilai CT’ dalam tes Covid-19, dan mengapa itu penting?

Nilai ambang siklus muncul dalam tes RT-PCR untuk virus corona, dan menentukan apakah seseorang positif Covid-19 atau tidak. Sejauh mana korelasinya dengan viral load dan tingkat keparahan penyakit?

Tes RT-PCR mendeteksi virus; Nilai Ct menetapkan tolok ukur apakah seseorang akan dihitung sebagai positif. (Foto Ekspres: Amit Mehra)

Di antara berbagai istilah ilmiah bahwa pandemi Covid-19 telah menjadi bagian dari kosakata publik, salah satunya adalah 'nilai Ct' dalam tes RT-PCR untuk menentukan apakah seorang pasien positif Covid-19.

Ini adalah subjek dari permintaan baru-baru ini yang dikirim oleh pemerintah Maharashtra ke Dewan Riset Medis India (ICMR). Negara mencari kejelasan apakah disarankan untuk memperlakukan seseorang sebagai Covid-negatif jika nilai Ct lebih dari 24 dan orang tersebut tidak menunjukkan gejala. Pejabat negara mengatakan berbagai dokumen ICMR telah menyebutkan nilai Ct yang berbeda dan ada pandangan yang berbeda bahkan di antara Niti Aayog dan Pusat Pengendalian Penyakit Nasional.

Beberapa hari kemudian, Dirjen ICMR menulis kembali kepada Menteri Kesehatan negara bagian bahwa ICMR telah mengambil masukan dari laboratorium virologi di seluruh negeri untuk mencapai satu nilai Ct cut-off. Semua pasien dengan nilai Ct kurang dari 35 dapat dianggap positif sementara mereka dengan nilai Ct di atas 35 dapat dianggap negatif, kata ICMR.

Tapi apa itu nilai Ct?

Singkatan dari cycle threshold, Ct adalah nilai yang muncul selama tes RT-PCR, standar emas untuk mendeteksi virus corona SARS-CoV-2 . Dalam tes RT-PCR, RNA diekstraksi dari swab yang dikumpulkan dari pasien. Kemudian diubah menjadi DNA, yang kemudian diamplifikasi. Amplifikasi mengacu pada proses membuat banyak salinan materi genetik — dalam hal ini, DNA. Ini meningkatkan kemampuan tes untuk mendeteksi keberadaan virus. Amplifikasi terjadi melalui serangkaian siklus — satu salinan menjadi dua, dua menjadi empat, dan seterusnya — dan setelah beberapa siklus, jumlah virus yang terdeteksi diproduksi.

Menurut penasehat ICMR, nilai Ct dari reaksi RT-PCR adalah jumlah siklus di mana fluoresensi produk PCR terdeteksi di atas dan di atas sinyal latar belakang. Sederhananya, nilai Ct mengacu pada jumlah siklus setelah virus dapat dideteksi. Jika jumlah siklus yang lebih tinggi diperlukan, ini menyiratkan bahwa virus tidak terdeteksi ketika jumlah siklus lebih rendah. Semakin rendah nilai Ct, semakin tinggi viral load — karena virus telah terlihat setelah siklus yang lebih sedikit.

Buletin| Klik untuk mendapatkan penjelasan terbaik hari ini di kotak masuk Anda

Mengapa nilai CT penting?

Untuk menempatkannya dalam konteks, mari kita lihat nasihat ICMR dan surat Maharashtra kepada ICMR. Menurut ICMR, seorang pasien dianggap positif Covid jika nilai Ct di bawah 35. Dengan kata lain, jika virus terdeteksi setelah 35 siklus atau lebih awal, maka pasien dianggap positif. Jika tolok ukur diturunkan menjadi 24 — nilai yang disebutkan dalam surat Maharashtra — itu berarti nilai Ct dalam kisaran 25-34 tidak akan dianggap positif. Oleh karena itu, tolok ukur 35 berarti bahwa lebih banyak pasien akan dianggap positif daripada yang akan kita dapatkan jika tolok ukurnya adalah 24. ICMR mengatakan menurunkan parameter ambang batas Ct dapat menyebabkan hilangnya beberapa orang menular.

Seseorang dapat menganggap nilai Ct sebagai ukuran potensi penularan, kata ahli virologi terkemuka Dr Shahid Jameel. Jadi jika ada lebih banyak virus di tenggorokan dan hidung saya, saya akan menularkannya dengan lebih baik, kata Dr Jameel, Direktur Trivedi School of Biosciences di Ashoka University.

Apa pentingnya ambang batas ICMR 35?

Secara global, batas yang diterima untuk nilai Ct untuk Covid-19 berkisar antara 35 dan 40, tergantung pada instruksi dari masing-masing produsen peralatan pengujian. ICMR telah mencapai nilai Ct 35 berdasarkan pengalaman laboratorium dan masukan yang diambil dari beberapa laboratorium virologi.

Tidak ada imbauan baru, tetapi ICMR memberi tahu pemerintah Maharashtra bahwa tidak disarankan untuk menggunakan parameter ambang batas siklus yang lebih rendah karena akan menyebabkan hilangnya beberapa orang menular dan meningkatkan penularan penyakit, kata Dr Balram Bhargava, Ditjen ICMR.

Apakah ada korelasi antara nilai Ct dan keparahan penyakit?

Tidak. Meskipun nilai Ct berkorelasi terbalik dengan viral load, namun tidak berpengaruh pada tingkat keparahan penyakit, kata para ahli. Seorang pasien dapat memiliki nilai Ct yang rendah, yang berarti viral load-nya cukup tinggi untuk dideteksi dengan cepat, tetapi ia mungkin masih asimtomatik.

Sebuah studi kecil yang diterbitkan dalam Indian Journal of Medical Microbiology pada Januari tahun ini menemukan bahwa tidak ada korelasi antara nilai Ct dan tingkat keparahan penyakit atau kematian pada pasien dengan penyakit Covid-19. Ditemukan bahwa waktu sejak timbulnya gejala memiliki hubungan yang lebih kuat dengan nilai Ct dibandingkan dengan tingkat keparahan penyakit.

Nilai Ct memberi tahu kita tentang viral load di tenggorokan dan bukan di paru-paru, kata Dr Parikshit Prayag, konsultan penyakit menular di Rumah Sakit Deenanath Mangeshkar, Pune. Nilai Ct tidak berkorelasi dengan keparahan – hanya dengan infektivitas. Di laporan pertama saya tidak terlalu melihat nilai Ct, tapi untuk tindak lanjut pasien di rumah sakit, saya mempertimbangkan nilai Ct, sehingga saya bisa memutuskan apakah pasien akan dipindahkan ke gedung non-Covid atau tidak. . Dari sudut pandang infektivitas, itu bisa menjadi masalah, bukan keparahan, kata Dr Prayag.

Apakah nilai Ct yang tinggi selalu berarti viral load yang rendah?

Sementara itu mungkin kesimpulan yang jelas, beberapa ahli menekankan bahwa beberapa pasien dapat memiliki nilai Ct tinggi namun memiliki tingkat infeksi Covid-19 yang sangat signifikan, dan sebaliknya. Banyak faktor yang penting dalam menafsirkan tes RT-PCR, dan hasilnya mungkin juga bergantung pada metode pengumpulan spesimen dan waktu dari infeksi hingga pengumpulan dan analisis.

Sebuah penasehat ICMR pada bulan Agustus tahun lalu mencatat bahwa nilai Ct tergantung pada bagaimana sampel telah dikumpulkan. Sampel yang dikumpulkan dengan buruk mungkin mencerminkan nilai Ct yang tidak sesuai. Selain itu, nilai Ct juga ditentukan oleh kompetensi teknis orang yang melakukan pengujian, kalibrasi peralatan, dan kemampuan analisis juru bahasa.

Sekali lagi, nilai Ct mungkin berbeda antara spesimen hidung dan orofaringeal yang dikumpulkan dari individu yang sama. Suhu transportasi, serta waktu yang dibutuhkan dari pengumpulan hingga penerimaan di lab, juga dapat berdampak buruk pada nilai Ct.

Bagikan Dengan Temanmu: