Dijelaskan: Seberapa cepat jenis virus corona baru menyebar? Apakah akan mempengaruhi vaksinasi?

Strain virus corona baru di Inggris: India dan beberapa negara lain telah menangguhkan penerbangan ke dan dari Inggris. Mutasi apa yang menyebabkan varian virus corona yang menimbulkan kekhawatiran? Seberapa cepat penyebarannya? Dan apakah itu akan berdampak pada vaksinasi?

Penerbangan dari Inggris dibatalkan di bandara Cointrin, di Jenewa, Swiss, 21 Desember 2020. (Foto Reuters: Denis Balibouse)

Pada hari Senin India menangguhkan semua penerbangan dari dan ke Inggris hingga 31 Desember, di tengah kekhawatiran tentang a varian baru dari SARS-CoV-2 yang menyebar & berkembang pesat di sana. Beberapa negara lain juga telah menangguhkan penerbangan Inggris dan memberlakukan pembatasan perjalanan.

Apa kekhawatiran ini yang menyebabkan pembatasan perjalanan?

Pekan lalu, varian baru SARS-CoV-2 terungkap menjadi alasan di balik lonjakan cepat kasus Covid-19 di Inggris Selatan dan Timur. Ini disebut sebagai VUI (Variant Under Investigation) 202012/01, atau garis keturunan B.1.1.7.

Selama beberapa hari terakhir, berkat kemampuan genomik kelas dunia kami, kami telah mengidentifikasi varian baru dari virus corona , yang mungkin terkait dengan penyebaran yang lebih cepat di Inggris Selatan, Sekretaris Kesehatan Inggris Matt Hancock mengatakan kepada House of commons pada 14 Desember. Otoritas Inggris telah memberi tahu Organisasi Kesehatan Dunia tentang varian tersebut.

Kesehatan Masyarakat Inggris (PHE) mengumumkan bahwa 1.108 kasus dengan varian ini telah diidentifikasi pada 13 Desember, terutama di Inggris Selatan dan Timur. PHE bekerja dengan mitra untuk menyelidiki dan berencana untuk membagikan temuannya selama 2 minggu ke depan, katanya.

Seperti apa variannya?

Varian tersebut diidentifikasi dalam pengawasan genomik oleh COVID-19 Genomics UK (COG-UK), sebuah konsorsium yang menganalisis data sekuensing genom dari Inggris. COG-UK adalah kontributor terbesar untuk database global Covid-19 GISAID.

Varian ini merupakan hasil dari beberapa mutasi pada protein lonjakan virus corona baru SARS-CoV-2, serta mutasi pada daerah genomik lain dari virus RNA. Analisis awal menunjukkan bahwa itu lebih menular daripada varian yang beredar sebelumnya. COG-UK mengidentifikasi salah satu mutasi ini sebagai N501Y, di area protein lonjakan yang mengikat protein kunci dalam sel manusia, reseptor ACE2. Ini merupakan indikasi bahwa perubahan secara teoritis dapat menyebabkan virus menjadi lebih menular. Upaya sedang dilakukan untuk mengkonfirmasi apakah mutasi ini berkontribusi pada peningkatan penularan, kata konsorsium.

Apa yang kita ketahui sejauh ini tentang penularan, dan tingkat keparahan penyakit?

Pada hari Minggu, PHE mengatakan data dari sekuensing seluruh genom, epidemiologi dan pemodelan menunjukkan bahwa varian baru mentransmisikan lebih mudah daripada strain lainnya.

Namun, ia juga menekankan bahwa tidak ada bukti bahwa varian tersebut lebih mungkin menyebabkan penyakit parah atau kematian. … Tapi kami melanjutkan penyelidikan untuk memahami ini dengan lebih baik, katanya. Dikatakan kematian adalah indikator tertinggal dan akan terus memantau ini selama beberapa minggu mendatang.

PHE mengaku belum mengetahui mekanisme peningkatan penularan ini. Kita tahu bahwa mutasi pada protein lonjakan, bagian dari virus yang membuatnya menular, dapat mengubah cara virus berinteraksi dengan sel manusia, katanya.

Dikatakan bukti menunjukkan bahwa tingkat infeksi di wilayah geografis di mana jenis tertentu telah beredar telah meningkat lebih cepat dari yang diharapkan, dan bukti pemodelan telah menunjukkan bahwa varian ini memiliki tingkat penularan yang lebih tinggi daripada varian lain yang beredar saat ini.

Strain virus corona baru di Inggris: Seorang petugas polisi mengarahkan lalu lintas di pintu masuk terminal feri yang ditutup di Dover, Inggris, Senin, setelah Pelabuhan Dover ditutup. (Foto AP)

Seberapa besar perhatian adalah transmisibilitas yang lebih tinggi?

Pada 18 Desember, Kelompok Penasihat Ancaman Virus Pernafasan Baru dan Muncul (NERVTAG), yang memberi nasihat kepada pemerintah Inggris tentang ancaman yang ditimbulkan oleh virus pernapasan baru dan yang sedang berkembang, mengatakan varian baru berpotensi meningkatkan jumlah reproduksi penyakit hingga 0,93. . Dikatakan memiliki keyakinan moderat bahwa varian baru menunjukkan peningkatan substansial dalam transmisibilitas dibandingkan dengan varian lain.

Badan ahli, bagaimanapun, menyimpulkan bahwa saat ini tidak ada cukup data untuk menarik kesimpulan tentang mekanisme yang mendasari peningkatan penularan, distribusi usia kasus dan tingkat keparahan penyakit. Dikatakan 4 kematian di sekitar 1.000 kasus telah diidentifikasi, tetapi pekerjaan lebih lanjut diperlukan untuk membandingkan tingkat kematian ini dengan set data yang sebanding.

Lokasi mutasi dalam domain pengikatan reseptor dari glikoprotein spike meningkatkan kemungkinan bahwa varian ini secara antigen berbeda dari varian sebelumnya. Empat kemungkinan infeksi ulang telah diidentifikasi di antara 915 subjek dengan varian ini tetapi pekerjaan lebih lanjut diperlukan untuk membandingkan tingkat infeksi ulang ini dengan kumpulan data yang sebanding, katanya.

Pada hari Minggu, laporan singkat penilaian ancaman yang diterbitkan oleh Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa mengatakan analisis filogenetik mengungkapkan bahwa klaster tersebut berbeda dengan 29 substitusi nukleotida dari galur asli Wuhan. Tiga sekuens dari Denmark dan satu dari Australia, dari sampel yang dikumpulkan pada November 2020, mengelompok dengan varian Inggris, kemungkinan besar menunjukkan bahwa penyebaran internasional telah terjadi, meskipun sejauh mana masih belum diketahui, katanya.

Strain virus corona baru di Inggris: Pelabuhan Dover ditutup ketika negara-negara UE memberlakukan larangan perjalanan dari Inggris. (Foto Reuters)

Tapi apakah virusnya tidak bermutasi sebelumnya?

Setiap kali virus bereplikasi dan bersirkulasi dalam populasi manusia, mutasi terjadi secara alami, dengan laju sekitar satu hingga dua mutasi per bulan dalam filogeni global.

Faktanya, untuk SARS-CoV-2, COG-UK mengatakan bahwa saat ini ada sekitar 4.000 mutasi pada protein lonjakan. Varian D614G sebelumnya merupakan strain yang dominan karena penyebarannya sangat mudah. Strain lain yang berasal dari pekerja pertanian Spanyol, 20A. EU1, menyebar dengan cepat ke seluruh Eropa di musim panas.

Sulit untuk memprediksi apakah mutasi tertentu penting ketika pertama kali muncul, dengan latar belakang munculnya mutasi baru yang terus-menerus. Memahami signifikansi mereka dimungkinkan berdasarkan pekerjaan eksperimental yang menunjukkan hubungan antara mutasi dan perubahan halus dalam biologi virus. Namun, dibutuhkan waktu dan upaya yang cukup besar untuk menguji efek dari ribuan kombinasi mutasi, kata COG-UK.

Apakah ini akan berdampak pada pengembangan dan respons vaksin?

Pada hari Minggu, pihak berwenang Inggris mengatakan pekerjaan laboratorium lebih lanjut sedang dilakukan sebagai prioritas untuk memahami hal ini. Saat ini tidak ada bukti yang menunjukkan bahwa vaksin Pfizer tidak akan melindungi orang dari jenis baru, kata PHE.

Bagikan Dengan Temanmu: