Dijelaskan: Lima langkah untuk mendeteksi virus corona (COVID-19)
Prosesnya dijelaskan kepada The Indian Express oleh Dr V Ravi, Profesor Senior & Kepala, Departemen Neurovirologi, NIMHANS.
Darah palsu terlihat dalam tabung reaksi berlabel virus corona (COVID-19) dalam ilustrasi yang diambil 17 Maret 2020. (Reuters) Dr V Ravi, Profesor Senior dan Kepala, Departemen Neurovirologi, NIMHANS, menjelaskan proses pendeteksian virus corona kepada situs ini . Berikut lima langkahnya:
Pengumpulan dan transportasi
Pusat pengujian mengambil swab dari rongga hidung dan bagian belakang tenggorokan (faring), dan menempatkan sampel dalam media pengangkut virus, yang mengandung garam dan albumin yang seimbang untuk mencegah virus hancur. Sampel kemudian diangkut dalam cold storage ke laboratorium pengujian.
Ekstraksi RNA virus
Virus corona seperti SARS-CoV (yang muncul di China pada 2002-2003), MERS-CoV (yang muncul di Arab Saudi pada 2012), atau SARS-CoV-2 saat ini yang menyebabkan pandemi COVID-19, memiliki dampak besar , genom RNA untai tunggal. Laboratorium pengujian mengekstrak RNA dari sampel, menggunakan kit yang tersedia secara komersial (seperti yang dibuat oleh perusahaan seperti QIAGEN.)
Menempatkan THE RNA dalam campuran THE PCR
RNA yang diekstraksi ditambahkan ke campuran reaksi berantai polimerase (PCR). Ini termasuk 'master mix', yang berisi enzim 'reverse transcriptase' yang mengubah RNA menjadi DNA. Campuran induk mengandung Taq polimerase, enzim yang membuat salinan DNA, nukleotida, serta elemen lain seperti magnesium — ion yang diperlukan untuk mengamplifikasi DNA.
Campuran PCR juga mengandung 'reagen' seperti 'primer' dan 'probe'. Primer adalah untaian DNA tertentu yang dirancang untuk berikatan dengan DNA yang akan disalin; probe digunakan untuk mendeteksi urutan spesifik dalam sampel DNA. WHO telah merekomendasikan primer dan probe khusus untuk pengujian COVID-19.
Akhirnya, campuran PCR terdiri dari gen rumah tangga — gen manusia normal (RNase P) yang digunakan untuk memastikan bahwa sampel dikumpulkan dengan benar, dan RNA diekstraksi.
AmpLifikasi DNA virus
Sampel dalam campuran PCR-nya dimasukkan ke dalam tabung atau pelat, yang kemudian dimasukkan ke dalam mesin thermal cycler yang digunakan untuk melakukan proses PCR.
Pertama, RNA diubah menjadi DNA. Kemudian proses menyalin gen dimulai. Siklus termal memanaskan dan mendinginkan campuran dengan sampel, bergantian antara tiga suhu — untuk melelehkan DNA untuk memisahkan dua untai, untuk primer untuk mengikat DNA, dan untuk mensintesis untai baru — semua dalam satu siklus yang berlangsung a menit. Pengendara sepeda termal menjalankan 30-40 siklus seperti itu untuk memperkuat DNA untuk memeriksa virus.
Pengujian terhadap kontrol
DNA yang diamplifikasi diuji terhadap kontrol positif, yang biasanya terdiri dari gen virus yang diklon ke dalam plasmid, dan kontrol negatif, yang merupakan sampel 'diketahui' yang telah diuji negatif untuk virus sebelumnya.
RNase P harus menunjukkan amplifikasi, kontrol positif harus positif, kontrol negatif harus negatif, dan kemudian apa pun hasil yang Anda dapatkan untuk spesimen, adalah hasil yang benar, kata ahli neurovirologi Dr V Ravi. Agar tes menjadi valid sebelum hasilnya dirilis, 'kriteria validitas' tertentu harus dipenuhi.
Jangan lewatkan dari Dijelaskan | Cara kerja tes COVID-19
Jika housekeeping gene (RNase P) positif, kontrol positif positif, kontrol negatif negatif, dan sampel tidak menunjukkan hasil PCR positif, sampel dinyatakan negatif RNA virus SARS-CoV-2. Jika hasil PCR positif, pasien tersebut mengidap COVID-19.
Bagikan Dengan Temanmu:
